Il Presidente dell'Unione viene eletto a maggioranza tra i componenti dell'Assemblea.
L'incarico del Presidente dura tre anni. L'attuale Presidente dell'UTI Giuliana – Julijska MTU, eletto dall'Assemblea dei Sindaci in data 21 settembre 2016 è il Sindaco del Comune di Trieste, Roberto Dipiazza.
- Nominare eventuali Vicepresidenti, i quali, assieme al Presidente costituiscono l'Ufficio di Presidenza
- Convocare e presiedere l'Assemblea dei Sindaci e l'Ufficio di Presidenza
- Nominare il Direttore, ovvero il vertice gestionale
- Emettere direttive rivolte al vertice, con il scopo di indirizzi funzionali e vigilanza sull'intera amministrazione dei servizi, come anche la verifica dei risultati
- Presentare il Piano dell'Unione all'Assemblea per l'approvazione